111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1323 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  89.39 
 
 		 179 aa  328  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  77.65 
 
 		 179 aa  268  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  77.65 
 
 		 179 aa  268  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  56.57 
 
 		 173 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  58.33 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  58.33 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  61.18 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  41.57 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  42.7 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  41.24 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  40.68 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  41.24 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  41.57 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  41.57 
 
 		 178 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  41.01 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2713  fimbrial protein  68.24 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  38.46 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  33.92 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  34.03 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  28.95 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  34.3 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  33.72 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  33.72 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  33.72 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  33.72 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  33.72 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  33.72 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  32.21 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  33.14 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  31.08 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  27.97 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  29.05 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  26.32 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.89 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.33 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.33 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.33 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.33 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  28.89 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.33 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  30.06 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  29.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  30.86 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  30.06 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  30.49 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  30.25 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  30.13 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  28.33 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.91 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  31.91 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  31.91 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  31.91 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.39 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  26.39 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  26.39 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  26.39 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  31.76 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  31.76 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  31.76 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  31.21 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  29.71 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.71 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  27.78 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.91 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.91 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  30.59 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.91 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  27.22 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  30.59 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  26.39 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  29.91 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  29.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  29.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  27.7 
 
 		 177 aa  44.7  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  29.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  27.55 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  28.24 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  24.43 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.37 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  30.12 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  30.08 
 
 		 313 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  28.31 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  24.84 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  30.47 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  24.84 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  24.43 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  24.43 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  24.43 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  24.43 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.99 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  25.99 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  25.99 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  25.16 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  25.16 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>