More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0900 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  56.6 
 
 		 669 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  77.71 
 
 		 651 aa  1070    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  77.71 
 
 		 651 aa  1070    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  69.79 
 
 		 683 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  69.98 
 
 		 684 aa  948    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  100 
 
 		 652 aa  1354    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  57.72 
 
 		 640 aa  733    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  77.71 
 
 		 1156 aa  1070    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  52.91 
 
 		 667 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  72.47 
 
 		 689 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  54.75 
 
 		 671 aa  678    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  69.98 
 
 		 684 aa  948    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  57.16 
 
 		 668 aa  736    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  48.62 
 
 		 656 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  44.64 
 
 		 620 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  41.21 
 
 		 674 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  44.44 
 
 		 684 aa  286  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  32.08 
 
 		 641 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  30.77 
 
 		 688 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  38.37 
 
 		 687 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  34.29 
 
 		 600 aa  197  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  34.77 
 
 		 696 aa  196  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  32.72 
 
 		 689 aa  194  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  32.12 
 
 		 624 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  34.71 
 
 		 586 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  41.98 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  32.77 
 
 		 693 aa  166  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  42.71 
 
 		 257 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  42.71 
 
 		 257 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  42.08 
 
 		 227 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  35.94 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  39.49 
 
 		 381 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  38.46 
 
 		 251 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  38.46 
 
 		 251 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  35.68 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  30.26 
 
 		 599 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  38.86 
 
 		 247 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  36.44 
 
 		 564 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.92 
 
 		 251 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  41.25 
 
 		 237 aa  138  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  38.26 
 
 		 282 aa  137  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  45.91 
 
 		 280 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  40.56 
 
 		 258 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  43.64 
 
 		 247 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  40 
 
 		 287 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  42.07 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  39.16 
 
 		 216 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  29.27 
 
 		 612 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  40.11 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  31.53 
 
 		 345 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  39.29 
 
 		 230 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  41.46 
 
 		 280 aa  124  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  41.46 
 
 		 280 aa  124  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  43.04 
 
 		 280 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  36.72 
 
 		 248 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  33.65 
 
 		 247 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  42.5 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  45.93 
 
 		 279 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  45.35 
 
 		 279 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  36.84 
 
 		 247 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  39.51 
 
 		 244 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  42.05 
 
 		 281 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  40 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  41.77 
 
 		 229 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  41.77 
 
 		 229 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  39.29 
 
 		 179 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  29.18 
 
 		 391 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  40.72 
 
 		 284 aa  107  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  36.31 
 
 		 284 aa  106  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  36.75 
 
 		 243 aa  104  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  36.14 
 
 		 284 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  33.75 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  38.41 
 
 		 234 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  35.8 
 
 		 260 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  30.94 
 
 		 780 aa  93.6  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  30.57 
 
 		 780 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  41.5 
 
 		 242 aa  90.9  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  41.35 
 
 		 226 aa  90.9  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  34.86 
 
 		 260 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  25.39 
 
 		 1179 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  24.67 
 
 		 623 aa  86.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  26.79 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  33.91 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  28.15 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  28.15 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  32.05 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  37.4 
 
 		 214 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  27.67 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  39.68 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  36.42 
 
 		 400 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  27.03 
 
 		 770 aa  79  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  33.59 
 
 		 207 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  33.08 
 
 		 197 aa  75.5  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  32.82 
 
 		 210 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  33.33 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1247  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.88 
 
 		 196 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.063421 
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.3 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  34.78 
 
 		 203 aa  75.1  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  33.08 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  35.11 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>