More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0992 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  81.42 
 
 		 184 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  76.8 
 
 		 188 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  64.32 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 184 aa  225  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  40.11 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  41.57 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  39.55 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  39.89 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  38.42 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  39.33 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  37.64 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  33.7 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  32.8 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  31.11 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 183 aa  104  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  30.39 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  29.83 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  28.16 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0311  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.92 
 
 		 503 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02750  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549892  normal  0.0746214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  28.25 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  29.28 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  26.54 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  29.12 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  31.9 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  27.11 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1309  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.54 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  29.9 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.48 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  28.09 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  28.25 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  28.25 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  28.25 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  28.25 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 432 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  31.1 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>