More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0177 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 429 aa  857    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  51.16 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  43.6 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  44.62 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  37.28 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  38.93 
 
 		 361 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  32.53 
 
 		 296 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  36.24 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  38.93 
 
 		 361 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  38.93 
 
 		 361 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  38.93 
 
 		 361 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  38.93 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  37.63 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  37.63 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.63 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  37.63 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  37.63 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  37.63 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  37.63 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  37.63 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  37.28 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  35.89 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  34.72 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  38.85 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  37.14 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  39.23 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  38.85 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  36.68 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  29.43 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  32.82 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  35.64 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  33.33 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  32.41 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  33.1 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  33.81 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  32.29 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  29.18 
 
 		 340 aa  153  5.9999999999999996e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  32.52 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  29.73 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  39.89 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  36.23 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  37.72 
 
 		 233 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 203 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  37.43 
 
 		 272 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  35.85 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  35.85 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  34.52 
 
 		 203 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.93 
 
 		 203 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.93 
 
 		 241 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  33.33 
 
 		 203 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 203 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 203 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.33 
 
 		 241 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.33 
 
 		 241 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  34.32 
 
 		 215 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  33.71 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 		 197 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 		 199 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  35.8 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  39.82 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  36.43 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 		 719 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  32.95 
 
 		 709 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.68 
 
 		 747 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  34.3 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  42.24 
 
 		 603 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  30.99 
 
 		 574 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 748 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  33.73 
 
 		 661 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 677 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  33.13 
 
 		 593 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  33.13 
 
 		 593 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 		 300 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  34.12 
 
 		 690 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  34.16 
 
 		 181 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.14 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40.52 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.57 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  32.57 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  31.79 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  32.16 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  31.82 
 
 		 709 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  31.79 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 		 647 aa  70.1  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  32.32 
 
 		 798 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  35.33 
 
 		 661 aa  69.7  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  35.95 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.95 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 		 218 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  33.14 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 190 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 		 195 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.81 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>