98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1089 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  631  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  99.03 
 
 		 308 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  40.76 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  39.62 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  37.67 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  34.92 
 
 		 299 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  76 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  59.78 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  54.64 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  52.52 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  59.15 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  28 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  28 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  24.53 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  27.38 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.8 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  25.93 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  26.26 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  24.76 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  25.71 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  27.08 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  22.45 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  22.22 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  25.63 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  22.63 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  37 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  20.22 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  34.97 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  20.05 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  24.13 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  32.43 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  23.86 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  22.11 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  20 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.67 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.33 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  24.41 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  34.57 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  24.41 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  23.6 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  22.48 
 
 		 281 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  28.38 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  27.01 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  21.31 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  23.37 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  20.16 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  20.16 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  20.87 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  31.65 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  31.17 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  22.02 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  37.66 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  31.3 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  36.92 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  31.65 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  23.72 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.12 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  31.87 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  24.66 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  30.56 
 
 		 165 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  22.59 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  22.71 
 
 		 318 aa  45.8  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  30.56 
 
 		 165 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  26.14 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  28.36 
 
 		 441 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  37.5 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  29.69 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  29.69 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  30 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  35.53 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  23.31 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  35.53 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  35.53 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  35.53 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  35.53 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 241 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  35.53 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  29.11 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  35.53 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  24.46 
 
 		 334 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  25.74 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  26.03 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  27.51 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  36.14 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  36.62 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>