More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0133 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  685    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  92.84 
 
 		 335 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  91.03 
 
 		 335 aa  570  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  79.07 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  70.36 
 
 		 330 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  69.16 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  65.55 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  67.44 
 
 		 331 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  60.98 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  54.77 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  54.9 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  53.42 
 
 		 328 aa  348  9e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  53.09 
 
 		 328 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  53.59 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  51.7 
 
 		 328 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  55.12 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  51.7 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  51.72 
 
 		 324 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  50.16 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  50.67 
 
 		 324 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  51.97 
 
 		 323 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  50.16 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  49.83 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  48.79 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  48.79 
 
 		 329 aa  308  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  49.83 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  48.5 
 
 		 327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  49.01 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  49.01 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  47.22 
 
 		 328 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  46.67 
 
 		 331 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  46.13 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  46.33 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  47 
 
 		 331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  44.33 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  46.15 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  39.46 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  43.23 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  45.15 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  45.15 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  41.12 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  42.11 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.24 
 
 		 327 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.8 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  42.59 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  39.81 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.38 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.47 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 		 332 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  41.12 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  40.45 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  39.14 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  40.73 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  38.4 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.03 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.55 
 
 		 328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  40.78 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.96 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.81 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  39.81 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  38.63 
 
 		 329 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.06 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.41 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.1 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  43.69 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.4 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.27 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.19 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.27 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.19 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.07 
 
 		 331 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  39.5 
 
 		 335 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.67 
 
 		 351 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.07 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.05 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.32 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.59 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.59 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.36 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.36 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  39.02 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.93 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.61 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  39.21 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.93 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.85 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.69 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  37.3 
 
 		 698 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  38.23 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  40.33 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.99 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.13 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  36.39 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>