More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3354 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  66.82 
 
 		 229 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.75 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  64.98 
 
 		 222 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  68.66 
 
 		 226 aa  264  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  68.2 
 
 		 226 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  64.06 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  63.76 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  61.01 
 
 		 219 aa  257  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  60.83 
 
 		 255 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  61.11 
 
 		 217 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  60.19 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  61.57 
 
 		 222 aa  245  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  57.14 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  60.37 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  56.48 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  58.33 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  58.06 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  58.45 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  57.6 
 
 		 221 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  50.46 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  52.07 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  50.92 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  50.92 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  50.46 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  48.62 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  47.93 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  49.08 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  49.08 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  48.62 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  47.93 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  46.81 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  48.85 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.54 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  44.09 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  45.62 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  43.64 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  45.21 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  45.66 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  44.24 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  44.7 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  43.84 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  41.01 
 
 		 246 aa  177  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  43.52 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  45.91 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.84 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.29 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.29 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  45.87 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  42.86 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.27 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  45.45 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.01 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  41.23 
 
 		 247 aa  174  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  45.62 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 230 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.73 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  49.07 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  43.93 
 
 		 244 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  44.24 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  39.63 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  44.04 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  43.3 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  50.72 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  39.91 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  50.72 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.82 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.29 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  38.14 
 
 		 604 aa  171  5.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0890  ABC transporter related  44.75 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  43.3 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  44.29 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2085  ABC transporter related  48.4 
 
 		 244 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>