More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1676 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  58.15 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  55.61 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  55.19 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  51.35 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  53.8 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  43.72 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  43.32 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  37.77 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  38.04 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  34.76 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  41.77 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 196 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  38.83 
 
 		 190 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  40.21 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  41.36 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  38.04 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.63 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  37.02 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  39.25 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  34.76 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  38.54 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  37.1 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  37.84 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.48 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  39.34 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  37.1 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  37.1 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.1 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.33 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.1 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.1 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  40.62 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  38.98 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.1 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  41.03 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  36.17 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  36.17 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  41.11 
 
 		 203 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  37.43 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.76 
 
 		 207 aa  111  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.33 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  36.17 
 
 		 200 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.56 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  36.56 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  35.87 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  34.43 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  35.83 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  42.33 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  36.36 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  38.62 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  39.13 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  43.71 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  39.75 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  39.75 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  37.1 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  36.65 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  35.68 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  38.92 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  34.76 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  43.04 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  38.41 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  39.36 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  39.63 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.85 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  35.11 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  39.76 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  34.57 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  38.22 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  44.21 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  35.11 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  34.41 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.43 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.04 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.04 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  35.48 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.98 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  36.41 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  33.75 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.75 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.04 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  40.11 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.75 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.04 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.04 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  37.58 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  37.58 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  37.58 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.75 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  34.24 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  41.62 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  37.77 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  35.48 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  35.48 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  36.7 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  39.58 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  32.8 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>