More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2148 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  100 
 
 
225 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  70.27 
 
 
225 aa  325  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  58.72 
 
 
229 aa  277  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  53.42 
 
 
228 aa  266  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
227 aa  265  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  56.62 
 
 
230 aa  259  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  53.64 
 
 
227 aa  256  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  55.36 
 
 
226 aa  256  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
244 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  52.49 
 
 
226 aa  245  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  52.05 
 
 
258 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.43 
 
 
245 aa  235  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  50.47 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  50.92 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  50.92 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  52.15 
 
 
253 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  50.69 
 
 
266 aa  231  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.77 
 
 
280 aa  230  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.7 
 
 
277 aa  230  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  49.53 
 
 
258 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  50.93 
 
 
253 aa  229  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  49.77 
 
 
268 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  50.92 
 
 
293 aa  228  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.17 
 
 
263 aa  228  6e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  50.94 
 
 
291 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
271 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  49.3 
 
 
264 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
266 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  49.76 
 
 
256 aa  222  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.34 
 
 
264 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  47.71 
 
 
259 aa  222  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  48.15 
 
 
258 aa  221  7e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.15 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
279 aa  218  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  47.2 
 
 
269 aa  218  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.91 
 
 
255 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  48.34 
 
 
252 aa  218  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  49.76 
 
 
312 aa  218  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
255 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 
279 aa  217  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  47.69 
 
 
247 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  47.73 
 
 
288 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  51.69 
 
 
257 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.06 
 
 
274 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
271 aa  214  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  47.87 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  47.85 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  46.98 
 
 
455 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  46.79 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  48.82 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  46.48 
 
 
255 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.49 
 
 
233 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  46.48 
 
 
255 aa  211  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.4 
 
 
239 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
227 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  44.95 
 
 
228 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
220 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  49.11 
 
 
258 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  46.12 
 
 
230 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
245 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.91 
 
 
238 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 
240 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  49.06 
 
 
302 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
230 aa  208  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 
221 aa  207  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  47.39 
 
 
445 aa  207  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  47.69 
 
 
250 aa  207  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  47.25 
 
 
257 aa  207  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.34 
 
 
235 aa  207  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
246 aa  207  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  207  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
255 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
234 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
243 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.17 
 
 
258 aa  206  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  49.52 
 
 
252 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
319 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
221 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
228 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  45.7 
 
 
228 aa  205  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.12 
 
 
228 aa  205  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.25 
 
 
237 aa  205  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  46.61 
 
 
233 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.58 
 
 
234 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4665  ABC transporter, ATP binding protein  50.23 
 
 
262 aa  204  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.12 
 
 
227 aa  204  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  45.13 
 
 
228 aa  205  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.66 
 
 
251 aa  204  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 
224 aa  204  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  47.3 
 
 
225 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  51.67 
 
 
660 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.26 
 
 
247 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.66 
 
 
235 aa  203  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  45.05 
 
 
259 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.65 
 
 
234 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.65 
 
 
234 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
255 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>