More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1391 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  100 
 
 		 358 aa  716    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  54.42 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0347  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  53.01 
 
 		 366 aa  355  6.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2723  acetyl-lysine deacetylase  49 
 
 		 366 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2180  acetyl-lysine deacetylase  49.28 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.749889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3459  acetyl-lysine deacetylase  48.07 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  45.53 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  41.4 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6288  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  42.49 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  40.83 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  42.09 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2612  acetyl-lysine deacetylase  39.66 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.880671  normal  0.701984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0324  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  38.33 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1757  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  37.6 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.49 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0451  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.14 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.75 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.05 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.11 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.06 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  29.71 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  27.86 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  23.01 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.06 
 
 		 359 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.56 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.65 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  27.96 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  25.56 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  22.25 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.45 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.11 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  24.47 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  28.69 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.52 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  27.56 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  24.69 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.17 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  26.93 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  24 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  24.81 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.54 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  29.8 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  24.27 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.4 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  23.86 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.82 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  25.54 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  27.27 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.42 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  28.28 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  27.9 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  27.88 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.57 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.67 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  25.62 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.84 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  25 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  25.45 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.8 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.46 
 
 		 416 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  23.47 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.41 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  24.11 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.41 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.4 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.41 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  23.29 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  23.29 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3336  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.77 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0627884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.4 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  23.29 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  23.29 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  22.51 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.73 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  27.58 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  23.29 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  27.8 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  23.29 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  23.29 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  25.72 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  32.14 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  26.79 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.68 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  23.48 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.06 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>