More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1330 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1330  ABC transporter related  100 
 
 		 571 aa  1149    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.987639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  41.05 
 
 		 598 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  37.77 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  37.48 
 
 		 576 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.28 
 
 		 588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  30.32 
 
 		 583 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.07 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.77 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.87 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.9 
 
 		 592 aa  288  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.97 
 
 		 581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  35.36 
 
 		 580 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.45 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.78 
 
 		 1228 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.54 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.38 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  29.89 
 
 		 577 aa  279  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  29.89 
 
 		 577 aa  279  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  36.7 
 
 		 577 aa  279  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.04 
 
 		 577 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.32 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.57 
 
 		 596 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  36.12 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.83 
 
 		 574 aa  274  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  33.96 
 
 		 587 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.93 
 
 		 577 aa  273  5.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 581 aa  273  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.56 
 
 		 588 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.57 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  31.41 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  37.79 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  31.2 
 
 		 573 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.7 
 
 		 581 aa  270  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.92 
 
 		 573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.54 
 
 		 607 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 590 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  40.45 
 
 		 596 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.08 
 
 		 1091 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  37.1 
 
 		 609 aa  267  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  32.56 
 
 		 593 aa  267  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  34.62 
 
 		 592 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.75 
 
 		 581 aa  266  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.09 
 
 		 597 aa  266  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.3 
 
 		 608 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.46 
 
 		 578 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.08 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  37.65 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.46 
 
 		 578 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  33.39 
 
 		 584 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.15 
 
 		 577 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 578 aa  263  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.95 
 
 		 585 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  34.42 
 
 		 593 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  37.06 
 
 		 603 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.22 
 
 		 578 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  33.82 
 
 		 565 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.36 
 
 		 600 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 599 aa  258  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.9 
 
 		 600 aa  257  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  40.42 
 
 		 595 aa  256  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.77 
 
 		 574 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 		 571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.87 
 
 		 580 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.17 
 
 		 613 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.57 
 
 		 588 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.69 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.87 
 
 		 599 aa  253  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  31.47 
 
 		 587 aa  253  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  31.47 
 
 		 587 aa  253  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.95 
 
 		 579 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  33.47 
 
 		 582 aa  253  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 		 618 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.71 
 
 		 604 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  30.77 
 
 		 602 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.5 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  37.11 
 
 		 608 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  37.14 
 
 		 603 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.59 
 
 		 618 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  37.77 
 
 		 582 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.45 
 
 		 596 aa  249  7e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  36.99 
 
 		 603 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  37 
 
 		 606 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.32 
 
 		 568 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.71 
 
 		 576 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 598 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  30.67 
 
 		 581 aa  246  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  34.7 
 
 		 598 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.4 
 
 		 579 aa  246  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  33.53 
 
 		 578 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 		 600 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  41.04 
 
 		 601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 		 603 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  35.66 
 
 		 606 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.58 
 
 		 595 aa  243  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  30.58 
 
 		 574 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  38.32 
 
 		 601 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.04 
 
 		 581 aa  243  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>