More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1892 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 643 aa  1305    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 686 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  34.08 
 
 		 660 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  36.12 
 
 		 643 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  33.65 
 
 		 643 aa  341  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 641 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 642 aa  336  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  34.39 
 
 		 649 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  34.71 
 
 		 642 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  34.87 
 
 		 642 aa  329  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  33.89 
 
 		 657 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  33.72 
 
 		 650 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 		 637 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 661 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 663 aa  313  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  32.56 
 
 		 642 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.72 
 
 		 642 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  32.79 
 
 		 576 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.44 
 
 		 669 aa  286  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 		 671 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  30.71 
 
 		 641 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 641 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  30.87 
 
 		 641 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 641 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.42 
 
 		 593 aa  272  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  30.55 
 
 		 641 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  30.24 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  30.13 
 
 		 641 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  30.33 
 
 		 641 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  30.33 
 
 		 641 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 		 641 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  34.68 
 
 		 654 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  31.47 
 
 		 645 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.48 
 
 		 641 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  31.75 
 
 		 644 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  30.99 
 
 		 648 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.7 
 
 		 661 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  29.57 
 
 		 649 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  29.77 
 
 		 642 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.7 
 
 		 638 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  29.8 
 
 		 643 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  29.91 
 
 		 650 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  28.37 
 
 		 645 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  28.73 
 
 		 642 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.34 
 
 		 647 aa  230  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  29.33 
 
 		 649 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  28.82 
 
 		 644 aa  229  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  29.67 
 
 		 640 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  29.16 
 
 		 649 aa  229  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.82 
 
 		 650 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  32.82 
 
 		 716 aa  223  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  29.42 
 
 		 642 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  29.89 
 
 		 643 aa  219  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  26.74 
 
 		 648 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  30.43 
 
 		 661 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  28.5 
 
 		 653 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  30.51 
 
 		 645 aa  213  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  30.32 
 
 		 645 aa  213  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  30.35 
 
 		 645 aa  212  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  30.35 
 
 		 645 aa  212  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  30.35 
 
 		 645 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  28.37 
 
 		 639 aa  211  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  30.19 
 
 		 645 aa  210  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  28.37 
 
 		 639 aa  210  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  30.19 
 
 		 645 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  30.19 
 
 		 645 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  28.33 
 
 		 639 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  30.19 
 
 		 645 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  32.34 
 
 		 647 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  30.03 
 
 		 645 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  30.03 
 
 		 645 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  30.03 
 
 		 645 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  29.47 
 
 		 645 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  25.54 
 
 		 637 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  29.76 
 
 		 645 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  29.87 
 
 		 645 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  28.41 
 
 		 643 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  31.18 
 
 		 650 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 644 aa  206  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 		 650 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  27.68 
 
 		 628 aa  199  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  28.24 
 
 		 641 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  29.54 
 
 		 653 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  28.35 
 
 		 652 aa  196  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  29.58 
 
 		 655 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  29.7 
 
 		 676 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  29.5 
 
 		 660 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  27.55 
 
 		 693 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  29.38 
 
 		 707 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  28.02 
 
 		 655 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  27.52 
 
 		 678 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  28.9 
 
 		 650 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  28.41 
 
 		 657 aa  190  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  28.97 
 
 		 651 aa  190  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  28.55 
 
 		 651 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  28.55 
 
 		 651 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  28.55 
 
 		 651 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  28.19 
 
 		 650 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  28.55 
 
 		 651 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  28.55 
 
 		 651 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>