More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4539 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4539  porin  100 
 
 		 382 aa  768    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  62.77 
 
 		 375 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  62.01 
 
 		 373 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  60.65 
 
 		 373 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  54.75 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  55.71 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  49.09 
 
 		 368 aa  358  8e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  52.86 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  51.85 
 
 		 372 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  50.71 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  50.29 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  52.14 
 
 		 364 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  48.17 
 
 		 374 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  47.68 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  45.24 
 
 		 385 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  46.07 
 
 		 382 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  46.13 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  46.07 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  45.25 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  43.75 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  46.88 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  46.88 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  46.88 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1076  outer membrane protein (porin)  44.73 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1076  outer membrane protein (porin)  44.73 
 
 		 362 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0592135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  43.68 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  45.7 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  45.11 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  45.11 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  42.56 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  45.38 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  45.11 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  45.11 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  45.11 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  42.52 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  42.46 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  41.99 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  40.47 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  39.27 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  37.97 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  37.2 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  36.5 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  33.6 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  36.25 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  35.32 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  35.32 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.28 
 
 		 357 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  35.45 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  35.22 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  36.44 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  36.09 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.71 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  37.01 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  37.31 
 
 		 383 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  36.13 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  35.13 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  36.13 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  35.71 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  34.31 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  36.41 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  33.41 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  33.41 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  34 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  34 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  35.01 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  34.25 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.58 
 
 		 368 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  32.93 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  35.43 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  34.46 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  35.34 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  35.4 
 
 		 368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.16 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  32.8 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.07 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.39 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.74 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  34.4 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  32.61 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.5 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  33.42 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.5 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.5 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.5 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.5 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  33.6 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.5 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.5 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  32.89 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.94 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  32.54 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  34.69 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  31.98 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.03 
 
 		 363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  32.6 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  30.19 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  30.19 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  32.07 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  29.95 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  35.23 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>