221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2460 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  100 
 
 		 384 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  56.85 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  54.95 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  54.69 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  55.58 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  55.58 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  55.32 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  55.84 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  55.84 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  55.32 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  53.3 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  52.33 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  54.08 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  52.33 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  54.81 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  47.19 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  42.67 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  45.53 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  33.33 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  41.45 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  42.19 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  40.27 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  51.08 
 
 		 188 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.66 
 
 		 466 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  32.86 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  32.93 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  32.51 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.81 
 
 		 384 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  31.31 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.08 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  31.36 
 
 		 409 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  30.37 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  30.81 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  30.81 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  31.82 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  31.34 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  29.98 
 
 		 405 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  31.01 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  30.68 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  30.66 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  31.76 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  30.41 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  32.88 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  31.05 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  30.19 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  29.95 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  29.95 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.95 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  29.71 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  29.95 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  29.95 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.71 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  31.62 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  31.46 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  31.44 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  32.41 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  31.97 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  31.68 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  31.23 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  31.72 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  29.67 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  31.76 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  27.99 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  30.45 
 
 		 473 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  31.93 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  30.64 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  28.64 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.11 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  30.64 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  30.64 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  30.89 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  32.1 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  29.63 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  29.56 
 
 		 474 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  31.59 
 
 		 472 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  29.52 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  29.47 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  30.2 
 
 		 407 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  31.02 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  30.23 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  31.57 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  30.28 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  31.46 
 
 		 465 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.49 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  31.28 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  30.28 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  31.53 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  28.91 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  28.84 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  25.9 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  31.4 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  29.08 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  29.14 
 
 		 498 aa  123  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  26.67 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  29.71 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  29.56 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  30.33 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  31.77 
 
 		 475 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  31.49 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  29.53 
 
 		 484 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>