More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0159 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  59.04 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  55.78 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  46.64 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  45.24 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  46.09 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  41.6 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  35.74 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 275 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 241 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 291 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 269 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  34.98 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.54 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  40.36 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  34.54 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  36.18 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  37.44 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  35.55 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  34.14 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 255 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>