139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4286 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  100 
 
 		 454 aa  923    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  32.14 
 
 		 458 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  35.58 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  34.67 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  41.96 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  24.86 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  50 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3806  hypothetical protein  43.16 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3757  hypothetical protein  43.16 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  54.74 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  26.13 
 
 		 591 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.45 
 
 		 1877 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  33.33 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  40.82 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 591 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2967  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  23.55 
 
 		 695 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011738  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.99 
 
 		 679 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 637 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  38.55 
 
 		 662 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  55 
 
 		 608 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.24 
 
 		 663 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.5 
 
 		 832 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.86 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0977353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  30.12 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.55 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  28.83 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  28.57 
 
 		 618 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  34.23 
 
 		 633 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  31.3 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  28.15 
 
 		 638 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  27.82 
 
 		 590 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.05 
 
 		 695 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1062  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.9 
 
 		 1027 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.782086  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  39.77 
 
 		 608 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.35 
 
 		 681 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.23 
 
 		 677 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.97 
 
 		 640 aa  53.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  39.77 
 
 		 608 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0545  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  21.67 
 
 		 676 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25556e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  28.75 
 
 		 557 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  20.35 
 
 		 574 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 		 628 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 658 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  23.23 
 
 		 810 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1487  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.07 
 
 		 659 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000879913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 604 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  27.56 
 
 		 630 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  22.89 
 
 		 759 aa  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 242 aa  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.22 
 
 		 890 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 935 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.8 
 
 		 665 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4780  histidine kinase  20.19 
 
 		 742 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 880 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 602 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  25.49 
 
 		 604 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.66 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000001862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 727 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.5 
 
 		 1153 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  26.76 
 
 		 667 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 525 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.5 
 
 		 1153 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  28.69 
 
 		 528 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.09 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.76 
 
 		 654 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  24.61 
 
 		 597 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 627 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  25.74 
 
 		 603 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.29 
 
 		 650 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 621 aa  47.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  23.15 
 
 		 620 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 771 aa  47.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  22.15 
 
 		 581 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  27.21 
 
 		 604 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5751  diguanylate cyclase  19.95 
 
 		 662 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  31.48 
 
 		 612 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  23.85 
 
 		 645 aa  46.6  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.34 
 
 		 1212 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  21.92 
 
 		 910 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  29.05 
 
 		 657 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  21.8 
 
 		 617 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 		 638 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 606 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  25.75 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3880  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  23.05 
 
 		 680 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4389  diguanylate cyclase  22.36 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 683 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.13 
 
 		 792 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  22.73 
 
 		 705 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3925  diguanylate cyclase  22.11 
 
 		 594 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  24.49 
 
 		 597 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2519  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.85 
 
 		 613 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28482e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  27.91 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>