188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1747 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 467 aa  947    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  23.44 
 
 		 482 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  21.83 
 
 		 491 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  22.9 
 
 		 937 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 		 1058 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  23.2 
 
 		 967 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  23.2 
 
 		 967 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  22.18 
 
 		 1133 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.89 
 
 		 1078 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  24.94 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  23.74 
 
 		 872 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  24.38 
 
 		 701 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  25.46 
 
 		 1130 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 674 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  23.52 
 
 		 1119 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  22.74 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 		 912 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  31.3 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  22.25 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.91 
 
 		 768 aa  63.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  20.13 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3387  adenylate/guanylate cyclase  23.01 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  32.65 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.17 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  22.02 
 
 		 705 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  22.47 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 		 646 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.1 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  29.66 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  21.83 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0178  methyl-accepting chemotaxis protein  25.2 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000210736  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.75 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 1026 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  19.7 
 
 		 1130 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  39.68 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  22.67 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.1 
 
 		 623 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  22.57 
 
 		 964 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.61 
 
 		 658 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.32 
 
 		 695 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0484461 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  26.36 
 
 		 652 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.1 
 
 		 623 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  24.14 
 
 		 633 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 		 689 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.1 
 
 		 661 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  37.93 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.46 
 
 		 623 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  36.51 
 
 		 665 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.44 
 
 		 650 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  26.09 
 
 		 695 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.55 
 
 		 658 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.751919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 		 651 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  26.17 
 
 		 660 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  19.55 
 
 		 1023 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.65 
 
 		 698 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  26.17 
 
 		 660 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.48 
 
 		 660 aa  53.9  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  23.53 
 
 		 1207 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.48 
 
 		 660 aa  53.9  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3806  hypothetical protein  41.54 
 
 		 163 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3757  hypothetical protein  41.54 
 
 		 163 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  20.92 
 
 		 648 aa  53.5  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 660 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  22.3 
 
 		 666 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  40.54 
 
 		 658 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 935 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  23.88 
 
 		 660 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  22.3 
 
 		 666 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  23.95 
 
 		 696 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  23.44 
 
 		 660 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 662 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  26.01 
 
 		 624 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 		 660 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 		 660 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  19.57 
 
 		 726 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 		 660 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  25.55 
 
 		 643 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  19.67 
 
 		 730 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  23.63 
 
 		 940 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.36 
 
 		 628 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  18.49 
 
 		 654 aa  51.2  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 658 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 		 1004 aa  50.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2305  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 371 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.08 
 
 		 880 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.62 
 
 		 658 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.91 
 
 		 666 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  34.62 
 
 		 658 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  22.64 
 
 		 608 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.26 
 
 		 666 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  19.78 
 
 		 945 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.36 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.4 
 
 		 705 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  18.47 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 		 706 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  22.64 
 
 		 608 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  32.46 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  32.46 
 
 		 660 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>