16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3757 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3757  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3806  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  40.19 
 
 		 411 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  53.66 
 
 		 371 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  41 
 
 		 458 aa  80.9  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  50.51 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  47.5 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  43.16 
 
 		 454 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  41.98 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  39.56 
 
 		 491 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  50.79 
 
 		 658 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  49.21 
 
 		 662 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  49.21 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  40.58 
 
 		 662 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  47.17 
 
 		 608 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 658 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>