25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2800 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  100 
 
 		 371 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3806  hypothetical protein  51.96 
 
 		 163 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3757  hypothetical protein  51.96 
 
 		 163 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  44.55 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  70.97 
 
 		 658 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  70.97 
 
 		 711 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  50 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  69.81 
 
 		 730 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  42.73 
 
 		 608 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  42.73 
 
 		 608 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  38.24 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  45.57 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1622  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.62 
 
 		 824 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  49.21 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  49.21 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  32.93 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  49.18 
 
 		 608 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  42.65 
 
 		 662 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  32.61 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 628 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  26.55 
 
 		 556 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  42.65 
 
 		 662 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  35.53 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 658 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>