More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0914 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
771 aa  1585    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
634 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
634 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
631 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
638 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  42.37 
 
 
670 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
602 aa  206  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  41.84 
 
 
627 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
627 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
672 aa  204  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  42.86 
 
 
615 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 
603 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
603 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  42.81 
 
 
603 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
627 aa  200  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
726 aa  200  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  42.96 
 
 
600 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  40.6 
 
 
623 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
621 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  41.46 
 
 
634 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  40.74 
 
 
659 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  42.35 
 
 
665 aa  197  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
607 aa  197  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 
598 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
628 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
598 aa  196  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
623 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 
652 aa  194  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
598 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  41.88 
 
 
598 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
598 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  40.8 
 
 
602 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  40.07 
 
 
616 aa  193  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  43.7 
 
 
617 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
668 aa  191  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  40.2 
 
 
635 aa  190  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
683 aa  187  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  40.43 
 
 
594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  38.93 
 
 
608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  40.07 
 
 
613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  41.03 
 
 
612 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  39.92 
 
 
630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
637 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  35.34 
 
 
601 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  39.45 
 
 
599 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  42.56 
 
 
622 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.76 
 
 
677 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.76 
 
 
677 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136.1  two-component sensor histidine kinase  31.41 
 
 
555 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  42.55 
 
 
623 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  37.28 
 
 
600 aa  180  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  39.38 
 
 
620 aa  180  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.52 
 
 
611 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  41.11 
 
 
604 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1136  putative C4-dicarboxylate transport sensor protein  26.36 
 
 
684 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00183456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  39.36 
 
 
618 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  37.54 
 
 
643 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.76 
 
 
677 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  38.46 
 
 
604 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  38.36 
 
 
643 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  39.16 
 
 
604 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
604 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.36 
 
 
643 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  38.36 
 
 
643 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
634 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  39.11 
 
 
630 aa  178  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  41.16 
 
 
615 aa  177  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  39.36 
 
 
633 aa  177  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
604 aa  177  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  38.44 
 
 
322 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  39.37 
 
 
604 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  36.77 
 
 
666 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  38.44 
 
 
310 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
634 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
634 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.14 
 
 
677 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
635 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  38.85 
 
 
604 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  32.35 
 
 
597 aa  174  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  36.3 
 
 
666 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
622 aa  174  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  44.15 
 
 
591 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  39.31 
 
 
600 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  42 
 
 
667 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2874  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
693 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0266107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  34.98 
 
 
669 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
618 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
669 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1815  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
583 aa  172  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
669 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
677 aa  172  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
672 aa  172  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  44.24 
 
 
638 aa  171  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06723  histidine kinase  24.96 
 
 
686 aa  171  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  34.67 
 
 
669 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  37.67 
 
 
626 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  39.3 
 
 
604 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  37.82 
 
 
621 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>