More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1510 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  99.69 
 
 
643 aa  634    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  99.69 
 
 
643 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  99.69 
 
 
643 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  100 
 
 
322 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  100 
 
 
310 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  57.28 
 
 
615 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.28 
 
 
635 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  57.43 
 
 
634 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  45.9 
 
 
645 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
683 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  45.45 
 
 
659 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  45.05 
 
 
616 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
668 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  44.33 
 
 
591 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  40.37 
 
 
666 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  41.32 
 
 
669 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  40.43 
 
 
666 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
672 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  41.72 
 
 
623 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
672 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
677 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
669 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  41.32 
 
 
669 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
669 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
634 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
634 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  42.14 
 
 
670 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  43.08 
 
 
627 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  41.32 
 
 
668 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 
631 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
638 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  40.88 
 
 
677 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  40.88 
 
 
677 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
628 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  41.51 
 
 
677 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  43.62 
 
 
665 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  40.94 
 
 
630 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  41.51 
 
 
677 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
627 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
623 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
627 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  43.11 
 
 
612 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  42.76 
 
 
599 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  40.6 
 
 
621 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  44.73 
 
 
630 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  43.45 
 
 
667 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  40.76 
 
 
597 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  40.27 
 
 
626 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40 
 
 
637 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
634 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  42.44 
 
 
621 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  41.18 
 
 
635 aa  178  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
635 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
634 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
771 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  38.08 
 
 
633 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.23 
 
 
611 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  37.81 
 
 
618 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  41.12 
 
 
600 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  37.82 
 
 
602 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  39.55 
 
 
635 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  41.16 
 
 
626 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
588 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
634 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  36.59 
 
 
623 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  39.78 
 
 
600 aa  168  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  38.91 
 
 
643 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
621 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
622 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  35.03 
 
 
622 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  39.78 
 
 
617 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
652 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  38.18 
 
 
604 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  42.55 
 
 
590 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
604 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  40.43 
 
 
638 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
585 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  34.75 
 
 
594 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  38.32 
 
 
604 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
604 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
618 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
598 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  37.96 
 
 
604 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  37.45 
 
 
604 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  34.95 
 
 
600 aa  158  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2129  sensor histidine kinase  38.06 
 
 
587 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  37.63 
 
 
625 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
620 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  37.01 
 
 
615 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  35.59 
 
 
604 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  37.96 
 
 
604 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  39.3 
 
 
586 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
591 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  37.63 
 
 
625 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1462  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
600 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277816  normal  0.69414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
597 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  37.68 
 
 
603 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
603 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
598 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
604 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>