97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0452 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  100 
 
 		 489 aa  988    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  26.63 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  23.34 
 
 		 937 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  25.36 
 
 		 491 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  25.83 
 
 		 1119 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 		 1133 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 1078 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  22.96 
 
 		 967 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  22.96 
 
 		 967 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 674 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 935 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.17 
 
 		 1058 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 816 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  25.27 
 
 		 872 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  24.86 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.43 
 
 		 1026 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  23.46 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  23.05 
 
 		 1207 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  23.08 
 
 		 705 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  23.68 
 
 		 730 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1130 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  26.5 
 
 		 608 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  23.73 
 
 		 608 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 		 945 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  20.97 
 
 		 608 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  30.7 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 790 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  28.38 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 912 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  23.08 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 913 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 		 726 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  29.2 
 
 		 356 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00583  cyclic diguanylate phosphodiesterase  22.74 
 
 		 848 aa  53.9  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  25.83 
 
 		 639 aa  53.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.01 
 
 		 610 aa  53.5  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0254049  normal  0.3858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  20.14 
 
 		 1130 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  19.41 
 
 		 729 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  24.32 
 
 		 708 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  32.61 
 
 		 371 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  29.33 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 759 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  30.68 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.72 
 
 		 618 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.627209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.89 
 
 		 626 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.45 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.33 
 
 		 609 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.67 
 
 		 623 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  25.83 
 
 		 627 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3100  chemotaxis sensory transducer  25.86 
 
 		 652 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.594551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  31.46 
 
 		 629 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.57 
 
 		 648 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.83 
 
 		 623 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  31.87 
 
 		 629 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.68 
 
 		 613 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  22.85 
 
 		 626 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  23.08 
 
 		 701 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 630 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30 
 
 		 630 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  26.01 
 
 		 705 aa  47  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 630 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 629 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  23.08 
 
 		 701 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 630 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.75 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  31.11 
 
 		 630 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.75 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  23.44 
 
 		 623 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 		 630 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.47 
 
 		 609 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0855945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  21.43 
 
 		 647 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.39 
 
 		 608 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  23.13 
 
 		 1023 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.4 
 
 		 695 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.93 
 
 		 698 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 630 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.01 
 
 		 627 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.9 
 
 		 625 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.45 
 
 		 626 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25 
 
 		 596 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001909  GGDEF family protein  21.4 
 
 		 848 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.35 
 
 		 623 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 630 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  24.05 
 
 		 622 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 630 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.66 
 
 		 667 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.52 
 
 		 698 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  33.7 
 
 		 660 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  24.8 
 
 		 633 aa  44.3  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  28.85 
 
 		 663 aa  43.9  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 667 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 875 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.47 
 
 		 605 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.47 
 
 		 605 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0770827  normal  0.965565 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 627 aa  43.5  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>