74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3657 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  100 
 
 		 355 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  40.69 
 
 		 800 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  39.22 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  39.22 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 858 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  41.36 
 
 		 313 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  41.28 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  41.28 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  36.93 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  38.16 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  33.44 
 
 		 299 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  34.24 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  30.48 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  28.62 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 872 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 862 aa  92.8  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  27.01 
 
 		 835 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  22.87 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  39.06 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  39.26 
 
 		 454 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 827 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  21.26 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  36.23 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 840 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3806  hypothetical protein  47.5 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3757  hypothetical protein  47.5 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.98 
 
 		 912 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  22.81 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  34.07 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 		 946 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  26.32 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  23.51 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.59 
 
 		 812 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  45.57 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 810 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  41.41 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  55.93 
 
 		 608 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  22.74 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 		 1064 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  27.22 
 
 		 882 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.38 
 
 		 803 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  30.7 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  25.15 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  30.77 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  21.37 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  22.43 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  25.78 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05078  hypothetical protein  26.76 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  24.64 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  23.48 
 
 		 561 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  23.08 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  24.03 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.56 
 
 		 573 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  23.23 
 
 		 471 aa  52.8  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.96 
 
 		 720 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  50 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 968 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  48 
 
 		 711 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  21.43 
 
 		 560 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  27.21 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 807 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 		 556 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 		 608 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 		 608 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  22.03 
 
 		 562 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 		 658 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.21 
 
 		 700 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.36 
 
 		 856 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  20.75 
 
 		 534 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 676 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 676 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  38.67 
 
 		 730 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>