193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1137 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  100 
 
 		 458 aa  943    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  32.14 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  37.4 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  32.94 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  42.06 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3806  hypothetical protein  41 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3757  hypothetical protein  41 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  22.65 
 
 		 733 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  38.24 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  31.93 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2967  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  22.4 
 
 		 695 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.99 
 
 		 676 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.479493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4780  histidine kinase  23.91 
 
 		 742 aa  66.6  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.63 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  28.38 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  50 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.89 
 
 		 808 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.73 
 
 		 654 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 788 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  33.66 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 859 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.32 
 
 		 808 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.961328  normal  0.598579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.49 
 
 		 681 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  23.38 
 
 		 604 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 		 705 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  20.33 
 
 		 591 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.69 
 
 		 716 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 652 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 		 1108 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 726 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388599  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  24.5 
 
 		 1268 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  19.73 
 
 		 612 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  25.14 
 
 		 569 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  26.09 
 
 		 527 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.02 
 
 		 596 aa  54.3  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  19.27 
 
 		 964 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1893  putative PAS/PAC sensor protein  23.92 
 
 		 879 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 563 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 662 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.9 
 
 		 662 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.5 
 
 		 645 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.89 
 
 		 645 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 637 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0545  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  22.51 
 
 		 676 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25556e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  20.23 
 
 		 699 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.52 
 
 		 621 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.5 
 
 		 645 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  25.35 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  22.66 
 
 		 657 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  24.86 
 
 		 644 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  23.25 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0809  chemotaxis sensory transducer  26.25 
 
 		 717 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  33.88 
 
 		 602 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.08 
 
 		 679 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  36.94 
 
 		 604 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  23.08 
 
 		 643 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 658 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 646 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.83 
 
 		 658 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  20.8 
 
 		 815 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.26 
 
 		 775 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.27 
 
 		 717 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1893  hypothetical protein  24.85 
 
 		 533 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0317418  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.02 
 
 		 720 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.99 
 
 		 713 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.15 
 
 		 749 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.38 
 
 		 995 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.36 
 
 		 1229 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  22.66 
 
 		 648 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.99 
 
 		 1562 aa  50.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 1193 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.08 
 
 		 655 aa  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  19.75 
 
 		 581 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.93 
 
 		 567 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 672 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2270  methyl-accepting chemotaxis protein  22.68 
 
 		 699 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000173504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2944  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.08 
 
 		 806 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0288682  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.5 
 
 		 567 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  33.33 
 
 		 622 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003591  GGDEF family protein  22.6 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5430  diguanylate cyclase  26 
 
 		 603 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406809  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.54 
 
 		 588 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2203  PAS:GGDEF  24.11 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  19.41 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  21.65 
 
 		 548 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 		 1113 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.45 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.627209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  18.71 
 
 		 639 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.78 
 
 		 885 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.2 
 
 		 596 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  20.3 
 
 		 696 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 873 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0239  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.7 
 
 		 793 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  18.52 
 
 		 627 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  29.66 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.82 
 
 		 596 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 638 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  23.15 
 
 		 645 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.49 
 
 		 627 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2508  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.67 
 
 		 627 aa  47.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>