More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0257 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  100 
 
 		 350 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  58.21 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  58.21 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  57.31 
 
 		 349 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  54.87 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  54.44 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  54.57 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  53.87 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  51.52 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  51.3 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  49.14 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  51.03 
 
 		 344 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  52.38 
 
 		 352 aa  361  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  48.34 
 
 		 347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  49.7 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  49.44 
 
 		 374 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  49.25 
 
 		 348 aa  348  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  47.46 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  48.97 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  47.56 
 
 		 372 aa  345  8e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  47.58 
 
 		 362 aa  345  8e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  48.14 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  48.96 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  49.43 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  47.98 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  46.89 
 
 		 374 aa  341  9e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  49.71 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  48.26 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  48.28 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.75 
 
 		 382 aa  339  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.01 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  47.67 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  47.97 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  47.19 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  46.15 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  47.7 
 
 		 358 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  47.38 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  46.86 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  47.28 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  45.93 
 
 		 358 aa  335  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  47.01 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  47.25 
 
 		 356 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  48.41 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  47.13 
 
 		 358 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  48.96 
 
 		 350 aa  332  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  48.36 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  48.41 
 
 		 345 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  48.41 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  48.18 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.55 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  48.13 
 
 		 345 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  47.76 
 
 		 347 aa  329  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  48.41 
 
 		 345 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  48.41 
 
 		 345 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  48.41 
 
 		 345 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  47.98 
 
 		 345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  47.55 
 
 		 349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  47.55 
 
 		 345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  47.55 
 
 		 345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  47.55 
 
 		 345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  46.13 
 
 		 365 aa  328  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  47.45 
 
 		 346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  48.06 
 
 		 345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  47.52 
 
 		 345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  46.55 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  48.36 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  47.26 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  47.84 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  47.45 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  46.06 
 
 		 347 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  47.14 
 
 		 566 aa  326  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  47.73 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  47.56 
 
 		 345 aa  326  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  46.4 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  47.4 
 
 		 347 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  47.76 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  45.51 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  48.06 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  46.72 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.51 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  46.85 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  44.96 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  45.19 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  44.54 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  46.15 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  45.19 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  47.48 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  45.76 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  47.02 
 
 		 369 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  44.25 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  47.14 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  46.82 
 
 		 347 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  46.82 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  45.03 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  46.25 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  45.95 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.13 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  48.83 
 
 		 347 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  46.13 
 
 		 366 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  45.66 
 
 		 358 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>