More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2887 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  100 
 
 		 529 aa  1045    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  88.28 
 
 		 555 aa  929    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  69.57 
 
 		 518 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  52.01 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  49.39 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  49.08 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  47.14 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  47.07 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  45.47 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  48.88 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  50 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  47.87 
 
 		 528 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  46.98 
 
 		 539 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  45.19 
 
 		 522 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  44.99 
 
 		 522 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  44.99 
 
 		 522 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  44.99 
 
 		 522 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  46.17 
 
 		 522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  44.6 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  44.99 
 
 		 522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  44.79 
 
 		 522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  49.49 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  46.17 
 
 		 522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  44.4 
 
 		 522 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  47.59 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  44.67 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  44.47 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  42.12 
 
 		 537 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  39.8 
 
 		 516 aa  329  8e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  41.16 
 
 		 518 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  34.36 
 
 		 519 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  47.9 
 
 		 341 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  30.12 
 
 		 526 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  33.89 
 
 		 520 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  33.89 
 
 		 520 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  31.76 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  31.54 
 
 		 530 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  32.98 
 
 		 653 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  32.98 
 
 		 671 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  32.53 
 
 		 661 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  32.37 
 
 		 531 aa  238  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  29.35 
 
 		 558 aa  236  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  32.97 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  33.05 
 
 		 606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  32.5 
 
 		 659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  33.19 
 
 		 678 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  33.68 
 
 		 698 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  32.81 
 
 		 659 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  29.02 
 
 		 490 aa  233  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  30.63 
 
 		 551 aa  230  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  31.94 
 
 		 661 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  29.39 
 
 		 506 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  32.26 
 
 		 567 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  32.22 
 
 		 508 aa  227  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  33.4 
 
 		 531 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  29.05 
 
 		 545 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0223  choline transport protein BetT  32.6 
 
 		 686 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  31.59 
 
 		 550 aa  226  8e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  31.55 
 
 		 681 aa  226  9e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.33 
 
 		 657 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  29.08 
 
 		 644 aa  224  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  32.02 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4827  BCCT transporter  31.85 
 
 		 664 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.767861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.01 
 
 		 637 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  31.14 
 
 		 573 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  34.42 
 
 		 673 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  30.11 
 
 		 497 aa  223  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5269  choline transporter  32.2 
 
 		 664 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0247  BCCT transporter  31.77 
 
 		 666 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  0.516419 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  31.65 
 
 		 548 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  31.65 
 
 		 548 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  30.33 
 
 		 503 aa  223  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  32.71 
 
 		 660 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  31.22 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  33.47 
 
 		 676 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  34.07 
 
 		 667 aa  220  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  32.43 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  35 
 
 		 524 aa  219  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  33.27 
 
 		 676 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  30.52 
 
 		 663 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  30.9 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  30.17 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  30.27 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0422  BCCT transporter  36.12 
 
 		 651 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0280485  normal  0.480367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  31.08 
 
 		 573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  30.52 
 
 		 684 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  30.41 
 
 		 494 aa  217  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  30.68 
 
 		 584 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  33.27 
 
 		 676 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  29.96 
 
 		 600 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2603  choline transport protein BetT  32.01 
 
 		 685 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158704 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  33.27 
 
 		 676 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  30.68 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  32.52 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  31.52 
 
 		 544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  30.45 
 
 		 580 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30890  choline/carnitine/betaine transport  33.91 
 
 		 572 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3436  choline/carnitine/betaine transporter  31.33 
 
 		 526 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.97143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  30.75 
 
 		 681 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  30.3 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>