More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2843 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
247 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  59.83 
 
 
242 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  59.4 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  58.55 
 
 
241 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  58.05 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  44.35 
 
 
255 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 
240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  35.52 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.47 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  33.71 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.52 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  31.65 
 
 
317 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.81 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  27.8 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
211 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  29.81 
 
 
210 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  30.52 
 
 
316 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.98 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  28.64 
 
 
200 aa  59.3  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.31 
 
 
329 aa  58.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.27 
 
 
207 aa  58.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 
209 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  32.4 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  31.48 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
205 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  27.09 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 
213 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.46 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.46 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.46 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.46 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.46 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
331 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
205 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 
222 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 
214 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
324 aa  55.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  29.81 
 
 
211 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  22.82 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  37.21 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  27.39 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.95 
 
 
334 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  25.67 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.92 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  25 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  34.68 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  29.74 
 
 
297 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  25.27 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 
344 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  27.37 
 
 
294 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>