More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2539 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  52.07 
 
 
725 aa  683    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  52.08 
 
 
724 aa  685    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  50.76 
 
 
724 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
719 aa  1461    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  49.86 
 
 
725 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  32.71 
 
 
802 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 
824 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 
722 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 
724 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 
787 aa  324  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
840 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  32.89 
 
 
713 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  31.95 
 
 
812 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 
717 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  30.97 
 
 
810 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  32.34 
 
 
747 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
738 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
738 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
727 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 
802 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 
819 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 
825 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  32.24 
 
 
719 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  32.24 
 
 
719 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  32.09 
 
 
752 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  30.6 
 
 
815 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 
722 aa  301  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  31.92 
 
 
720 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  30.93 
 
 
799 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 
745 aa  296  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 
724 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  31.26 
 
 
808 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 
831 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 
841 aa  294  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 
828 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  30.73 
 
 
812 aa  290  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  30.45 
 
 
807 aa  290  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 
719 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 
814 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
826 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 
817 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 
806 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 
800 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 
830 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 
828 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 
809 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
801 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
795 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 
703 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 
822 aa  280  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 
822 aa  278  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  30.92 
 
 
789 aa  277  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  31.46 
 
 
766 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 
803 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 
841 aa  274  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 
798 aa  274  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
803 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
723 aa  272  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 
816 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
841 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 
826 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 
841 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  28.82 
 
 
744 aa  266  8e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 
844 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 
836 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 
827 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.63 
 
 
825 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  28.09 
 
 
753 aa  261  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 
746 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 
753 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 
821 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.61 
 
 
747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 
765 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 
765 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 
803 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 
765 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.17 
 
 
724 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.03 
 
 
724 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 
723 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.03 
 
 
724 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 
833 aa  251  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
740 aa  250  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 
735 aa  250  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 
732 aa  249  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.64 
 
 
743 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.89 
 
 
724 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.03 
 
 
724 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 
729 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 
725 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
731 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 
748 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 
714 aa  243  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.2 
 
 
728 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
741 aa  240  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 
864 aa  240  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 
722 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 
741 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.75 
 
 
729 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.75 
 
 
729 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>