More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1729 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1729  D-xylose dehydrogenase  100 
 
 
245 aa  506  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.380531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.38 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 
258 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1363  D-xylose dehydrogenase  57.94 
 
 
268 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879722  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.66 
 
 
255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.66 
 
 
255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13973  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
251 aa  281  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 
257 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
256 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.138185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0597739  normal  0.690345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
256 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640028  hitchhiker  0.00000248708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0761  putative oxidoreductase  48.79 
 
 
255 aa  231  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.429001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
256 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00682949  normal  0.0302653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
256 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0224708  unclonable  0.0000202886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0771  GntR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
256 aa  224  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00515913  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
254 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.098133  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
254 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
256 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000241543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.283086  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.227086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 
251 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
264 aa  208  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.386853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
270 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304096  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1263  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.79 
 
 
268 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2483  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.79 
 
 
268 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
271 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3480  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.79 
 
 
268 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.538943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0403  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.79 
 
 
268 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.253369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3445  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.79 
 
 
268 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
271 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3483  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.79 
 
 
271 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
271 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0853252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.79 
 
 
268 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
261 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
271 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
258 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
270 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00753595  normal  0.67708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
266 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0549  putative short-chain dehydrogenase/reductase, FabG-like  45.2 
 
 
266 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.437639 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07128  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00131023  normal  0.0770254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1182  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.59 
 
 
271 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
271 aa  194  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0225727  hitchhiker  0.000000282328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
261 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132836  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0438  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
256 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
255 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
270 aa  188  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
258 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.236793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0503  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
253 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
255 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00136979  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
256 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51440  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  44.05 
 
 
260 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
256 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.742718 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
254 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1369  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
260 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
260 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
288 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.52 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
246 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
246 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
260 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0357  putative short-chain dehydrogenase  36.44 
 
 
246 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0963856  hitchhiker  0.00000797271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  33.2 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.73 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.66 
 
 
250 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
256 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
254 aa  128  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
257 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.86 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
282 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
252 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
249 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
252 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.41 
 
 
261 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
282 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
282 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.6 
 
 
246 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
250 aa  124  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
254 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
253 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
256 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
251 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  31.4 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.72 
 
 
263 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
247 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>