More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2145 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0597739  normal  0.690345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.06 
 
 
256 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.138185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.11 
 
 
256 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00682949  normal  0.0302653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.11 
 
 
256 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0224708  unclonable  0.0000202886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.11 
 
 
256 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640028  hitchhiker  0.00000248708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0761  putative oxidoreductase  59.38 
 
 
255 aa  322  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.429001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0771  GntR family transcriptional regulator  59.38 
 
 
256 aa  317  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00515913  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
254 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
264 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.386853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
258 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0549  putative short-chain dehydrogenase/reductase, FabG-like  51.2 
 
 
266 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
261 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.283086  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1182  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.2 
 
 
271 aa  251  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
256 aa  249  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000241543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2483  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.2 
 
 
268 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.2 
 
 
268 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1263  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.2 
 
 
268 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3445  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.2 
 
 
268 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3480  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.2 
 
 
268 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.538943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3483  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.2 
 
 
271 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0403  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.2 
 
 
268 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.253369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
266 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
266 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.227086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
270 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00753595  normal  0.67708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
271 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
271 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
254 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.098133  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
271 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0853252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0225727  hitchhiker  0.000000282328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
257 aa  241  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
270 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304096  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
251 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
258 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
255 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435673  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1363  D-xylose dehydrogenase  45.38 
 
 
268 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879722  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
261 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132836  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51440  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  47.6 
 
 
260 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
251 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
255 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
255 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13973  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1729  D-xylose dehydrogenase  48 
 
 
245 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.380531  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
256 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.742718 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
258 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.236793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1369  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
260 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 
260 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
255 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00136979  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
259 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0438  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
256 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285603 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07128  conserved hypothetical protein  36.74 
 
 
275 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00131023  normal  0.0770254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
257 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
270 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0503  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.82 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
254 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
251 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.81 
 
 
251 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
249 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
259 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
255 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.348466  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0357  putative short-chain dehydrogenase  34.26 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0963856  hitchhiker  0.00000797271 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
248 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
246 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.98 
 
 
247 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 
249 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.2 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.89 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3531  putative short-chain dehydrogenase  30.5 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138901  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
250 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
257 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
246 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
245 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
245 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.08 
 
 
246 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.98 
 
 
248 aa  125  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
256 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  28.91 
 
 
261 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 
256 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
276 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>