More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2599 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  532  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0771  GntR family transcriptional regulator  52.8 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00515913  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.283086  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
264 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.386853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
266 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0761  putative oxidoreductase  50.4 
 
 
255 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.429001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0549  putative short-chain dehydrogenase/reductase, FabG-like  52.34 
 
 
266 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.2 
 
 
258 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.53 
 
 
251 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 
270 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00753595  normal  0.67708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
254 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2483  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.8 
 
 
268 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
271 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3480  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.8 
 
 
268 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.538943  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
271 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1263  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.8 
 
 
268 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.8 
 
 
268 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
271 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0853252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3445  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  52.8 
 
 
268 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0403  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.8 
 
 
268 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.253369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3483  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  52.8 
 
 
271 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640028  hitchhiker  0.00000248708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
256 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0597739  normal  0.690345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1182  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.2 
 
 
271 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
256 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00682949  normal  0.0302653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
256 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.138185  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
256 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0224708  unclonable  0.0000202886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
266 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.227086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
251 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 
256 aa  250  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.742718 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
255 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13973  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
259 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
256 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000241543 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
255 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1363  D-xylose dehydrogenase  48 
 
 
268 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879722  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
271 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0225727  hitchhiker  0.000000282328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
261 aa  238  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132836  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1369  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.098133  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1729  D-xylose dehydrogenase  49.01 
 
 
245 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.380531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
261 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
256 aa  230  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
255 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
258 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.236793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
288 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07128  conserved hypothetical protein  43.38 
 
 
275 aa  226  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00131023  normal  0.0770254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51440  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  45.63 
 
 
260 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0438  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
270 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
255 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00136979  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0503  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
253 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
254 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.06 
 
 
246 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.06 
 
 
246 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
250 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0751362 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
252 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
249 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
246 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
250 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
249 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
247 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
254 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
256 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
249 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.55 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4708  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978516  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  32.53 
 
 
256 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
252 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
255 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  32.41 
 
 
251 aa  132  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3985  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 
256 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473882  normal  0.0186737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
275 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.52 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
249 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>