More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0157 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 486 aa  996    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.08 
 
 		 494 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  44.47 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.65 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 527 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  41.42 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 489 aa  334  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  41.28 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  41.61 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 488 aa  324  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 491 aa  324  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 512 aa  319  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  36.95 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 489 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.58 
 
 		 517 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.9 
 
 		 488 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.87 
 
 		 485 aa  206  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 493 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.27 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.38 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 498 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 495 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 493 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.32 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 496 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3272  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 493 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  31.57 
 
 		 508 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 501 aa  189  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.34 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.37 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 504 aa  186  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 490 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  25.67 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  28.13 
 
 		 479 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.39 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.69 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  31.26 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 466 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 492 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 492 aa  180  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  29.85 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  32.15 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.37 
 
 		 508 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1916  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  30.02 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 498 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.63 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 509 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.69 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 466 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>