More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3508 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  70.54 
 
 		 491 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 489 aa  996    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  54.83 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 488 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  48.96 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 508 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  43.22 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 508 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 496 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  44.6 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  41.46 
 
 		 506 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.31 
 
 		 513 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.41 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  41.7 
 
 		 501 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 497 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 493 aa  209  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 476 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 490 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 471 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  30.02 
 
 		 501 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 503 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 501 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 501 aa  189  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.43 
 
 		 495 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.7 
 
 		 488 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.42 
 
 		 497 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 490 aa  186  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  32.91 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 494 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 494 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 466 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  30.75 
 
 		 504 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.53 
 
 		 497 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 509 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.19 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 473 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 496 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.03 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 466 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 501 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 481 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.75 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.17 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.01 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.43 
 
 		 501 aa  177  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 493 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 470 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 488 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.37 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 502 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 466 aa  174  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 502 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 503 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 490 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 466 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>