More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0025 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 494 aa  1020    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 486 aa  571  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  44.38 
 
 		 509 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  44.19 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 508 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  44.42 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 508 aa  339  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  41.6 
 
 		 501 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 527 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.5 
 
 		 513 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  40.59 
 
 		 506 aa  332  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 489 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 495 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 491 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 488 aa  319  7e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 491 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  36.13 
 
 		 488 aa  289  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 499 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 488 aa  220  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 493 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.31 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 496 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.11 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.05 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.05 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  32.02 
 
 		 520 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 492 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.2 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 501 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  28.48 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 503 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  30.55 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 503 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 466 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 504 aa  193  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 475 aa  192  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.88 
 
 		 517 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 504 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.2 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  30.75 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.62 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 506 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 509 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 506 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 517 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.2 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 503 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 489 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  29.64 
 
 		 507 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 507 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 507 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.49 
 
 		 496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  29.22 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3680  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.44 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>