More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0071 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 496 aa  1004    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  50.3 
 
 		 508 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  49.9 
 
 		 509 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  50.1 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  50.3 
 
 		 509 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  47.38 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  46.18 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  46.26 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 527 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.55 
 
 		 513 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 489 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  43.67 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  41.46 
 
 		 488 aa  358  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 488 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  43.76 
 
 		 508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 491 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 499 aa  342  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.63 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 497 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 504 aa  239  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.21 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.87 
 
 		 488 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 488 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 494 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.67 
 
 		 485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 494 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.45 
 
 		 517 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 477 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.47 
 
 		 490 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 495 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 498 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.33 
 
 		 485 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 473 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.67 
 
 		 472 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 492 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  30.86 
 
 		 508 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 490 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 476 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3272  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 495 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 496 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 493 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 493 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  31.42 
 
 		 489 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 569 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 485 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3061  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 513 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908638  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1229  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 513 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0515  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 513 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1456  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 513 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0638  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 513 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1424  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 513 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1558  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 499 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 470 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 488 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 503 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 501 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  35.37 
 
 		 570 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  34.61 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  35.37 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.26 
 
 		 515 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 477 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  33.84 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  31.7 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>