More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  66.4 
 
 		 499 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  70.39 
 
 		 496 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  71.55 
 
 		 475 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  67.2 
 
 		 499 aa  652    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  69.11 
 
 		 495 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 503 aa  669    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  70.6 
 
 		 496 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 496 aa  981    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  53.39 
 
 		 504 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2017  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.70352  normal  0.217844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 501 aa  319  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.17 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 496 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.57 
 
 		 497 aa  312  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.19 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.01 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.98 
 
 		 501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4362  GntR family transcriptional regulator  66.12 
 
 		 271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 513 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 507 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 506 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 506 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 521 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.37 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 506 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 506 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  37.87 
 
 		 507 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 506 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 507 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 507 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 507 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 507 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 502 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 502 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 502 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.25 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.42 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.8 
 
 		 523 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 477 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 504 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.66 
 
 		 494 aa  289  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 495 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 476 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 503 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.54 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 503 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 509 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 492 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 523 aa  282  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 492 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.58 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 569 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 509 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 476 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 520 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 502 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 508 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 481 aa  279  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 509 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  39.21 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  33.74 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.3 
 
 		 504 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.74 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 506 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.07 
 
 		 507 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 494 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 516 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 494 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.7 
 
 		 490 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.59 
 
 		 471 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 473 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 564 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>