More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4617 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  98.26 
 
 		 516 aa  989    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1424  GntR family transcriptional regulator  77.82 
 
 		 513 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0638  GntR family transcriptional regulator  77.82 
 
 		 513 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3061  GntR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 513 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908638  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1229  GntR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 513 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1558  GntR family transcriptional regulator  77.75 
 
 		 499 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  91.26 
 
 		 497 aa  842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  91.22 
 
 		 501 aa  830    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  78.78 
 
 		 520 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  89.78 
 
 		 502 aa  862    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  90.18 
 
 		 502 aa  864    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0515  GntR family transcriptional regulator  77.82 
 
 		 513 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1456  GntR family transcriptional regulator  77.82 
 
 		 513 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 516 aa  1007    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  90.18 
 
 		 502 aa  864    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.16 
 
 		 500 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 506 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  42.83 
 
 		 507 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 506 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 509 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 507 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 506 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 506 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 506 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 490 aa  305  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  40.08 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 511 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.52 
 
 		 515 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 513 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 477 aa  299  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  41.7 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 521 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  42.13 
 
 		 476 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 569 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 501 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  37.83 
 
 		 523 aa  292  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 492 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.58 
 
 		 501 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 492 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.08 
 
 		 504 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.63 
 
 		 501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 492 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.03 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 509 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.26 
 
 		 501 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.37 
 
 		 495 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 509 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.44 
 
 		 488 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.74 
 
 		 485 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.71 
 
 		 497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.19 
 
 		 503 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 502 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 502 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 502 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 485 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 487 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 494 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.08 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.26 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 517 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.73 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.73 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 473 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 444 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 444 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.45 
 
 		 471 aa  279  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 546 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 561 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 564 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 564 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  36.5 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  38.48 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.75 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 476 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  40 
 
 		 494 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 496 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>