More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2297 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 501 aa  993    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 502 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 502 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  44.96 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 502 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 502 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  44.76 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.61 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.2 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  45.18 
 
 		 521 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  46.2 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  44.49 
 
 		 511 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 492 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  45.51 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.74 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.84 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  45.71 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  44.67 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  43.2 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  42.54 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.87 
 
 		 523 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 562 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.83 
 
 		 509 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 492 aa  352  8e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  42.69 
 
 		 508 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 564 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  44.69 
 
 		 564 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 490 aa  349  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 495 aa  349  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 505 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 506 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 503 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.53 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 492 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.7 
 
 		 497 aa  342  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  42.09 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  41.45 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.52 
 
 		 501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.06 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.87 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  43.72 
 
 		 492 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 492 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  43.37 
 
 		 488 aa  338  9e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 509 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.4 
 
 		 471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  42.26 
 
 		 495 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 501 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 501 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.97 
 
 		 495 aa  333  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  41.43 
 
 		 475 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.98 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  41.2 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 517 aa  329  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.24 
 
 		 494 aa  329  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 492 aa  329  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  40.39 
 
 		 520 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  40.49 
 
 		 478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  41.8 
 
 		 502 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.46 
 
 		 485 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 486 aa  323  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  43.56 
 
 		 481 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.04 
 
 		 485 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.23 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>