More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1334 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  99.2 
 
 
501 aa  1018    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  99.4 
 
 
501 aa  1020    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  100 
 
 
501 aa  1026    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  63.33 
 
 
497 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  63.11 
 
 
497 aa  624  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  62.12 
 
 
501 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  62.53 
 
 
495 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  58.62 
 
 
488 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  55.26 
 
 
499 aa  532  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  47.39 
 
 
569 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  50.7 
 
 
502 aa  465  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  47.13 
 
 
503 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
503 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.96 
 
 
501 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  46.88 
 
 
502 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
502 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
507 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  46.91 
 
 
502 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
501 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
502 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  46.68 
 
 
502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
506 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.48 
 
 
515 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
506 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
513 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  46.68 
 
 
507 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  46.68 
 
 
507 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  46.65 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  46.75 
 
 
507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  45.38 
 
 
520 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  47.22 
 
 
523 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  46.57 
 
 
511 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  47.35 
 
 
506 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  46.75 
 
 
521 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.88 
 
 
507 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  46.37 
 
 
504 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
564 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
564 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
546 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  45.79 
 
 
561 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  46.22 
 
 
562 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
564 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  45.6 
 
 
564 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
492 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
495 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
492 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.86 
 
 
494 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.59 
 
 
503 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  41.77 
 
 
490 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  41.47 
 
 
492 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.38 
 
 
489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  38.99 
 
 
495 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  41.47 
 
 
492 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  40.82 
 
 
502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.42 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
511 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
488 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  38.53 
 
 
488 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
488 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
488 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  40.6 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
496 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
507 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.86 
 
 
507 aa  326  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
486 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.32 
 
 
491 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  37.73 
 
 
496 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 
501 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
492 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  40.22 
 
 
488 aa  316  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.82 
 
 
500 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  38.73 
 
 
487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
503 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.2 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.67 
 
 
508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  39.71 
 
 
509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  34.45 
 
 
475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  38.2 
 
 
515 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  38.36 
 
 
490 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.98 
 
 
472 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
493 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 
520 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
473 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.86 
 
 
495 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  34.99 
 
 
496 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  38.11 
 
 
492 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
515 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
490 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.09 
 
 
471 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>