More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4852 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  78.42 
 
 
501 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  76.19 
 
 
502 aa  766    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  71.7 
 
 
546 aa  724    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  71.7 
 
 
564 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  71.7 
 
 
564 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  75.6 
 
 
503 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  75.34 
 
 
520 aa  790    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  76.74 
 
 
503 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  71.7 
 
 
564 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  73.01 
 
 
562 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  71.7 
 
 
561 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  71.7 
 
 
564 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  78.42 
 
 
501 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  76.19 
 
 
502 aa  766    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  76.39 
 
 
502 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  76.19 
 
 
502 aa  764    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  100 
 
 
523 aa  1059    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  76.19 
 
 
502 aa  766    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  59.64 
 
 
509 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.8 
 
 
515 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  60.52 
 
 
506 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  59.92 
 
 
506 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  59.92 
 
 
506 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  59.92 
 
 
506 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  59.92 
 
 
506 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  59.92 
 
 
506 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  59.52 
 
 
507 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  59.52 
 
 
507 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  59.52 
 
 
507 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  58.33 
 
 
511 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  59.52 
 
 
507 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  58.14 
 
 
513 aa  618  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  59.33 
 
 
507 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  59.33 
 
 
507 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  59.18 
 
 
521 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
569 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  54.26 
 
 
509 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  52.98 
 
 
504 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.98 
 
 
507 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.76 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.84 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.04 
 
 
495 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  48.4 
 
 
488 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  47.23 
 
 
497 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
501 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  47.5 
 
 
501 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  46.26 
 
 
499 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
501 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.77 
 
 
503 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.62 
 
 
494 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  47.06 
 
 
502 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
492 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  44.61 
 
 
495 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  43.78 
 
 
490 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
496 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 
492 aa  350  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
501 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.49 
 
 
507 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
507 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  39.52 
 
 
488 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
488 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
488 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
492 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.4 
 
 
489 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  41.03 
 
 
492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  40.61 
 
 
502 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
511 aa  326  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.57 
 
 
491 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
498 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
490 aa  322  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  40.61 
 
 
502 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
502 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  39.57 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
486 aa  313  5.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
517 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.33 
 
 
494 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 
475 aa  306  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  40.9 
 
 
487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  37.57 
 
 
520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  37.9 
 
 
508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  40.17 
 
 
488 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 
520 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.57 
 
 
472 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
490 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  38.66 
 
 
490 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.43 
 
 
499 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
470 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 
470 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  36.85 
 
 
509 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.66 
 
 
495 aa  296  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
509 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  35.93 
 
 
475 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  36.16 
 
 
478 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>