More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3074 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
470 aa  944    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  59.35 
 
 
472 aa  557  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.71 
 
 
471 aa  554  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  57.3 
 
 
476 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  49.47 
 
 
476 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.33 
 
 
481 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  50.11 
 
 
496 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.39 
 
 
509 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  49.21 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  48.45 
 
 
498 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
505 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.85 
 
 
473 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  46.41 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  45.93 
 
 
444 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
463 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  45.81 
 
 
444 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
444 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.05 
 
 
444 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
444 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
444 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.05 
 
 
444 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
458 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
470 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6089  transcriptional regulator  45.18 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3552  transcriptional regulator  43.97 
 
 
469 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
509 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
506 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
506 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.34 
 
 
503 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
469 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
506 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
496 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
501 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
506 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
506 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
492 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.3 
 
 
515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6987  transcriptional regulator  43.75 
 
 
469 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  40.9 
 
 
511 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  41.41 
 
 
502 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
507 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
502 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
502 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  39.96 
 
 
507 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
513 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
507 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
507 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  41.19 
 
 
503 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  40.39 
 
 
502 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
503 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.75 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
492 aa  309  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  41.34 
 
 
509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 
507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  40.44 
 
 
507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  39.24 
 
 
521 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  40.17 
 
 
520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
569 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.47 
 
 
504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
501 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
490 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.72 
 
 
489 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.26 
 
 
501 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
502 aa  300  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.29 
 
 
507 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  39.36 
 
 
523 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  38.54 
 
 
520 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
492 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  41.85 
 
 
488 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  40.84 
 
 
476 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
511 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
498 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
497 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 
564 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
502 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 
546 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
502 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
502 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 
564 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  38.88 
 
 
561 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  38.15 
 
 
506 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  42.17 
 
 
502 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.83 
 
 
523 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  38.46 
 
 
492 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  39.96 
 
 
488 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
488 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
488 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
492 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  41.8 
 
 
502 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.91 
 
 
497 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
516 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  40.43 
 
 
516 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  37.31 
 
 
499 aa  289  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  42.17 
 
 
502 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.12 
 
 
497 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
502 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
502 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>