More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3119 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  100 
 
 		 488 aa  967    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 502 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 502 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  79.84 
 
 		 489 aa  758    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  71.63 
 
 		 502 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 511 aa  661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  71.22 
 
 		 502 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  70.99 
 
 		 498 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 502 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  74.29 
 
 		 492 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 492 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 502 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 488 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  53.8 
 
 		 495 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  56.29 
 
 		 488 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 488 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 488 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  52.03 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.79 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.02 
 
 		 507 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.37 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.33 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 486 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  46.85 
 
 		 515 aa  359  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  47.31 
 
 		 492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  48.09 
 
 		 490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 524 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 492 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 492 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 569 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 509 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 506 aa  349  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 506 aa  349  8e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.68 
 
 		 494 aa  348  9e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  43.71 
 
 		 509 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.12 
 
 		 504 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 506 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.35 
 
 		 497 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.87 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.77 
 
 		 497 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 513 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 507 aa  335  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.67 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.67 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  40 
 
 		 521 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.83 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 501 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 502 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 502 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  42.36 
 
 		 502 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  41.2 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  42.15 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 501 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 502 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  42.05 
 
 		 488 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 507 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 503 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.88 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 501 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 490 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 509 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 501 aa  316  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 520 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 490 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  39.02 
 
 		 520 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  39 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  42.76 
 
 		 502 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 546 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 564 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 564 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 561 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 520 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.65 
 
 		 472 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.3 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 564 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 564 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 490 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 		 492 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>