More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5559 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  77.43 
 
 		 505 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  100 
 
 		 498 aa  1010    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  79.53 
 
 		 509 aa  777    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  86.14 
 
 		 496 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  50.72 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.83 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 470 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.54 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  48.05 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  46.04 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.96 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  44.47 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.96 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.96 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 463 aa  352  8.999999999999999e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 507 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  39.25 
 
 		 507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 506 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 506 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 513 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  39.38 
 
 		 507 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 469 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 511 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6987  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.37 
 
 		 515 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 501 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.03 
 
 		 503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 470 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 503 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.18 
 
 		 501 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3552  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 469 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 521 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6089  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 470 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 569 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.73 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.27 
 
 		 509 aa  293  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.94 
 
 		 502 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 502 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.09 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 506 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.65 
 
 		 507 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  36.33 
 
 		 520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.48 
 
 		 501 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  36.68 
 
 		 523 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 490 aa  286  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.26 
 
 		 495 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 487 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.3 
 
 		 500 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.55 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 562 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.49 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 485 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 520 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 546 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  36.34 
 
 		 561 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 499 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 564 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  39.1 
 
 		 516 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 564 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 516 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 476 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 501 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 485 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 502 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.36 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.57 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5165  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.469019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3960  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 501 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>