More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3888 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  100 
 
 		 488 aa  992    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  90.14 
 
 		 488 aa  890    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 488 aa  992    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 488 aa  992    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.83 
 
 		 489 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 492 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  53.66 
 
 		 492 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  56.29 
 
 		 488 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  52.58 
 
 		 495 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 511 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  52.75 
 
 		 502 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  52.77 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  52.75 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.18 
 
 		 491 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.34 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  44.73 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.34 
 
 		 503 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.74 
 
 		 497 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.28 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.76 
 
 		 497 aa  345  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  42.95 
 
 		 502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.57 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  43.26 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.64 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  41.44 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.42 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 507 aa  339  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 506 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  41.96 
 
 		 509 aa  338  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 569 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.83 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  43.61 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 507 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 507 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 507 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.87 
 
 		 495 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  39.52 
 
 		 523 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 507 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 501 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  38.65 
 
 		 520 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 524 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.53 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.13 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 501 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 492 aa  329  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 501 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 490 aa  326  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 521 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 495 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 564 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 564 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 546 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 561 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 562 aa  316  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 564 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 564 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 496 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  39.21 
 
 		 502 aa  303  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.24 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.56 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.78 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 478 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.58 
 
 		 514 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 504 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 		 473 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 490 aa  272  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 510 aa  269  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>