More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3945 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  100 
 
 
476 aa  943    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  67.31 
 
 
471 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  66.67 
 
 
472 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  57.3 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  51.5 
 
 
476 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.8 
 
 
473 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.99 
 
 
509 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
496 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  48.05 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  48.16 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.11 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  48.68 
 
 
478 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
444 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  45.61 
 
 
444 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
463 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
485 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  45.08 
 
 
444 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.86 
 
 
444 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
444 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.86 
 
 
444 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
444 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
458 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
492 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  45.5 
 
 
469 aa  319  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  44.1 
 
 
496 aa  319  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3552  transcriptional regulator  45.5 
 
 
469 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  43.07 
 
 
509 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.3 
 
 
514 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6987  transcriptional regulator  44.52 
 
 
469 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  44.24 
 
 
470 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 
476 aa  310  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.56 
 
 
503 aa  310  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.26 
 
 
501 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6089  transcriptional regulator  43.79 
 
 
470 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  38.36 
 
 
507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
507 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  40.87 
 
 
503 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  37.37 
 
 
507 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
507 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
507 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
507 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  38.09 
 
 
511 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.37 
 
 
500 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  39.96 
 
 
502 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
502 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.04 
 
 
515 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
509 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.68 
 
 
504 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  39.92 
 
 
502 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
506 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
502 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
506 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
502 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
473 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
506 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
513 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.92 
 
 
501 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
503 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.21 
 
 
507 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3960  transcriptional regulator  40.95 
 
 
586 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473267 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
506 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
506 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
506 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  40.13 
 
 
496 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  35.76 
 
 
499 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
516 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
495 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  35.82 
 
 
521 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  41 
 
 
520 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
501 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  41.05 
 
 
516 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  38.03 
 
 
523 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  33.88 
 
 
485 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
569 aa  286  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
492 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  40.09 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
492 aa  283  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  38.41 
 
 
520 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
485 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
503 aa  283  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
497 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
490 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  42.82 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
485 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.88 
 
 
485 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  42.82 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  41.79 
 
 
492 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
502 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
511 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
502 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
502 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  39.22 
 
 
506 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
498 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  42.63 
 
 
502 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>