More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5788 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  79.33 
 
 		 509 aa  774    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  76.54 
 
 		 505 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  86.14 
 
 		 498 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 496 aa  996    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.21 
 
 		 471 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  50 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  50.11 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  48.64 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.78 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  49.26 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.49 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 485 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  45 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.35 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.35 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  43.47 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 458 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 492 aa  326  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 507 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.32 
 
 		 515 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 506 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 506 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 506 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 506 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3552  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 469 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 507 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 507 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 507 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 507 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6987  transcriptional regulator  39.92 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  37.09 
 
 		 511 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 507 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 521 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6089  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 503 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.33 
 
 		 503 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 490 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.7 
 
 		 501 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 501 aa  293  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  39.06 
 
 		 509 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.77 
 
 		 504 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 476 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 569 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 499 aa  286  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.85 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  40.67 
 
 		 506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.61 
 
 		 507 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 503 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 523 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3960  transcriptional regulator  36.94 
 
 		 586 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 487 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.18 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  36.34 
 
 		 561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5165  GntR family transcriptional regulator  38.45 
 
 		 469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.469019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.62 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 492 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.63 
 
 		 485 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 516 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 503 aa  272  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 492 aa  272  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.75 
 
 		 497 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1062  MocR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.24 
 
 		 497 aa  272  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  39.37 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.39 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  41.52 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 562 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>