More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1108 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
492 aa  1028    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  60.04 
 
 
485 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  59.39 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.43 
 
 
485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  59.43 
 
 
485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  58.4 
 
 
487 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
496 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
569 aa  322  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
501 aa  315  9e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
492 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.39 
 
 
500 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
490 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
507 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
477 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  33.75 
 
 
520 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
507 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  35.43 
 
 
507 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 
515 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  32.24 
 
 
509 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
509 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
502 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  34.7 
 
 
502 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
502 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  33.26 
 
 
502 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  33 
 
 
520 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  34.73 
 
 
507 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
507 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
507 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
497 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  35.11 
 
 
501 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
509 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
501 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  34.23 
 
 
511 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
506 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.54 
 
 
501 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
501 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
502 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
502 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
506 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
506 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
509 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 
513 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
492 aa  289  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
506 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
506 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
501 aa  289  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
506 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  33.54 
 
 
503 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.88 
 
 
488 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 
503 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  32.84 
 
 
502 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  31.98 
 
 
508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
495 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  33.97 
 
 
476 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.16 
 
 
495 aa  286  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
502 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  32.24 
 
 
516 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  31.59 
 
 
517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  35.05 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.95 
 
 
501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.26 
 
 
497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.27 
 
 
503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  33.89 
 
 
475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.61 
 
 
488 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
493 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.86 
 
 
495 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
504 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
496 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
493 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.82 
 
 
497 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 
520 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
475 aa  280  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  33.26 
 
 
501 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2017  transcriptional regulator  34.83 
 
 
505 aa  279  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.70352  normal  0.217844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
492 aa  279  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  36.03 
 
 
499 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  34.49 
 
 
504 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  32.06 
 
 
520 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  33.13 
 
 
523 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.52 
 
 
494 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  33.05 
 
 
494 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
492 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
494 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
494 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  32.24 
 
 
521 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  31.37 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  31.9 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  31.99 
 
 
561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 
564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 
546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 
564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
505 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.91 
 
 
485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 
444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>