More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3611 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  65.63 
 
 		 504 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 485 aa  974    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  95.26 
 
 		 485 aa  930    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  61.69 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 504 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.27 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 490 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  61.93 
 
 		 509 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  61.32 
 
 		 494 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  61.52 
 
 		 494 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  61.76 
 
 		 495 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 574 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  57.26 
 
 		 493 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  57.06 
 
 		 493 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  56.85 
 
 		 570 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  53.48 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 477 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.37 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  46.61 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.27 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 509 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 509 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  39.28 
 
 		 508 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.42 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 493 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.57 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 517 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  38.12 
 
 		 475 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  37.25 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 467 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 485 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  37.42 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  36.29 
 
 		 520 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 490 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 485 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 487 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.41 
 
 		 471 aa  286  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.25 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  40.33 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.9 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 504 aa  284  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 492 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.76 
 
 		 499 aa  282  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.19 
 
 		 472 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.13 
 
 		 500 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  39.03 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.87 
 
 		 523 aa  277  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.01 
 
 		 495 aa  277  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 481 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.82 
 
 		 464 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 504 aa  276  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 488 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.01 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.74 
 
 		 497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.78 
 
 		 497 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 509 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 488 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.6 
 
 		 504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.08 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 470 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 501 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 463 aa  269  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 493 aa  269  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.79 
 
 		 503 aa  269  7e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 501 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.47 
 
 		 489 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>