More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4307 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  100 
 
 
488 aa  992    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  78.23 
 
 
499 aa  769    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  64.42 
 
 
497 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  63.41 
 
 
501 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  63.19 
 
 
497 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  62.17 
 
 
495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  59.4 
 
 
501 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  59.19 
 
 
501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  59.4 
 
 
501 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  54.16 
 
 
502 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  52.3 
 
 
569 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.51 
 
 
501 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  50.31 
 
 
501 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  50.3 
 
 
506 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  50.3 
 
 
506 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  50.3 
 
 
509 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  50.31 
 
 
509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  49.29 
 
 
511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  50.3 
 
 
506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  50.3 
 
 
506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  49.29 
 
 
507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  49.8 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.49 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  50.3 
 
 
506 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  48.69 
 
 
507 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  49.19 
 
 
503 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  48.69 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  46.86 
 
 
520 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  47.96 
 
 
521 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  49.49 
 
 
502 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  49.6 
 
 
503 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  48.47 
 
 
507 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
502 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  48.47 
 
 
507 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  48.4 
 
 
523 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  48.47 
 
 
507 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  49.49 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  50.92 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.2 
 
 
507 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  46.55 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
546 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
564 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
564 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
564 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
562 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  46.74 
 
 
564 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  46 
 
 
492 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.53 
 
 
503 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.22 
 
 
494 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
492 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  44.01 
 
 
495 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.27 
 
 
489 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.69 
 
 
507 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
496 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  41.44 
 
 
488 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
488 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
488 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.9 
 
 
491 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
488 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  42 
 
 
492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  39.75 
 
 
490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  41.28 
 
 
492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
502 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
502 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
498 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
511 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
502 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
502 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  42.77 
 
 
502 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  44.15 
 
 
501 aa  333  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  39.78 
 
 
495 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  42.92 
 
 
487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  41.6 
 
 
502 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  42.05 
 
 
488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
493 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.1 
 
 
494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  39.24 
 
 
520 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
486 aa  312  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 
509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  38.79 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.82 
 
 
509 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.97 
 
 
508 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 
520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.66 
 
 
485 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
485 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
487 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  39.57 
 
 
515 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
485 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  39.7 
 
 
490 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.57 
 
 
514 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.77 
 
 
471 aa  295  9e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
515 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>