More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3061 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1424  GntR family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 513 aa  991    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0638  GntR family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 513 aa  991    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3061  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 513 aa  993    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908638  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1558  GntR family transcriptional regulator  99.6 
 
 		 499 aa  961    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  77.12 
 
 		 516 aa  740    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1229  GntR family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 513 aa  990    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892193  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  77.73 
 
 		 502 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  76.52 
 
 		 497 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1456  GntR family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 513 aa  991    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0515  GntR family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 513 aa  991    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  78.69 
 
 		 501 aa  709    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  77.73 
 
 		 502 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  78.43 
 
 		 516 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  72.92 
 
 		 520 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  77.73 
 
 		 502 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.93 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 492 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 506 aa  319  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 506 aa  319  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 470 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 507 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.73 
 
 		 515 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  41.26 
 
 		 507 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 507 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.65 
 
 		 504 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  39.52 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  42.36 
 
 		 509 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.07 
 
 		 501 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.17 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 521 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.08 
 
 		 497 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.91 
 
 		 497 aa  297  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 490 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 502 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.12 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 569 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 477 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  39.79 
 
 		 489 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.5 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 503 aa  293  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.43 
 
 		 503 aa  292  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 501 aa  292  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.79 
 
 		 495 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 523 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 492 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 485 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 		 517 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.32 
 
 		 471 aa  289  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.23 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 498 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  43.05 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.76 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.92 
 
 		 490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 470 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  43.09 
 
 		 492 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 504 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 485 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 473 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.48 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  38.43 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.47 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 561 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 546 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 564 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 564 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 488 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>